当净化车间温度低于所设定温度两度以上（包括两度）之时，四通换向门阀转换，外机变蒸发器而车间内变冷凝器予车间内制热，如制热量不足时，会接通辅助电加热器给车间内空气加热，接通风机送至空调房间，达到加热目的。
当净化车间湿度高于所设定的温度5%之时，机器温湿度传感器会将其发现，并由其主机控制器向车间外发送信号并启动车间外机压缩机。车间内双系统的其中一组可以秒变成为冷凝器发挥制热作用，另一组发挥蒸发器作用进行制冷除湿，这可以在不改变车间内温度的情况下快速除湿。净化车间内温度高于设定温度时，净化系统会马上发送四通换向阀信号，在这个信号作用之下车间外变为冷凝器，车间内发挥蒸发器作用给车间内进行快速降温除湿。
风量大，风压差小，是机房空调与其他空调的本质区别。采用大风量，出风温度不会太低，增加机房换气次数，有利于服务器和电脑的运行。短时间内，机房温度变化太大会造成服务器运行错误，机房湿度太低会产生静电(湿度20%时静电可达10000伏)。
恒温恒湿空调对环境的温度、湿度、洁净度都有严格的控制，数据控制非常严格。由于其成本相对较高，每台空调的单价基本都在5W左右，所以恒温恒湿空调基本都用于工业和科技领域，在日常生活中并不多见。