洁净室工程采用静态验收方法进行检测时，第三方检测公司只注重清洁这个指标。虽然这样的验收对洁净室工程建设质量有一定判断，但由于验收状态与实际使用状况有很大的差别，洁净室在实际使用效果上也会有很大的差异。有统计显示：正常情况下，动态情况相比于静态情况的粉尘数量更多。当洁净室工程过滤系统有堵塞异常是，送风量会大幅度下降，从而降低洁净度。由此可见，动态环境下检测和验收装修工程比静态环境下更为可靠。不过，我国动态验收法还不如国外成熟，验收结果的准确性还有待提高。
风管若要达到洁净室工程的要求，在制作时必须要确保环境干净，无灰尘，无污染。当矩形风管边长小于等于900mm时，应特别注意底板不能有拼接的缝隙；当边长大于900mm时，底板不应有横向接缝。咬口、铆接、法兰应采用硅胶密封，密封前应清洗干净，密封后应严格检查。当风管制作完成后，还应该根据洁净室工程的相关要求利用中性洗涤剂清洗，将其表面的浮灰和油渍清洗干净。根据人们制作风管的经验，其清洗步骤为:咬口前除去风管表面浮尘→咬口组合成型后用专用清洗剂处理→中性剂清洗+清水擦洗，然后用白布擦净→白绸布检验+硅胶密封+透明塑料薄膜风口处理。
洁净室工程空调系统非常复杂，有的装修公司会采用中央空调系统控制不同的净化车间，有的装修公司则在每个净化车间都采用独立的空调系统，具体的设计方案需要参考工厂对装修的要求。有的工厂净化车间只分布于一个楼层，对应的洁净室工程空调系统相对简单，而有的工厂净化车间分布于不同的楼层，对应的空调系统设计较为复杂。由此可见，洁净室装修公司必须要具备丰富的经验，才能设计出合理的空调系统方案。
目前无尘室工程常用的风险分析方法是层次分析法，它是将影响工程项目决策的相关因素分解为目标、原则和方法等多个层次，通过定量和定向两方面对风险进行分析和评估。人们采用这种方法分析出机电安装存在的风险问题之后，就要根据问题拟定对应的解决方法，并且设立一个监督的岗位，对风险进行控制和管理。只有对无尘室工程机电安装过程进行严格的监督，才能确保解决方案有效落实。