实验室通风系统是整个实验室设计和建设过程中，规模、影响广泛的系统之一。通风系统的完善与否，直接对实验室环境、实验人员的身体健康、实验设备的运行维护等方面产生重要影响。
实验室过度负压，通风柜气体泄漏，实验室噪音等问题，一直是困扰实验室工作人员的难题。这些问题给长期在实验室中工作的人员，甚至工作在实验室周围的管理和后勤人员，造成了身体和心理上的严重伤害。一个科学、合理的通风系统要求通风效果好、噪音低、操作简便、节约能源，甚至要求室内压差和温湿度都能保持人体的舒适性。
医疗中心实验室设计前期准备
1、确定监测实验室的功能间和面积。这就需要实验方提供相关数据，包括医疗中心内已开展的检测项目和近3年准备开展的检测项目；每日的门诊量和医院的床位数。或者有些实验方内部已经做好相应规划设计的，可以直接提供所需功能间的名称、面积。
2、确定实验室的主要检测使用设备。填写工艺设备一览表，由实验方相关负责人尽量填充已确定需要的一些基本信息，包括设备、数量、尺寸、型号、重量、电压、功率等；如遇到不能确定的，或者不甚明白的，实验室设计人员会给相关负责人以技术指导。因为这些设备的相关信息直接决定后续工艺设计的把控、施工过程中地基怎么处理等系列问题。
3、实验方需要向设计师提供一份建筑平面图，并与工程设计人员协商确定检验科人员、清洁物、污物的出入口，并且人流物流路线不应和整个大楼的人物流路线冲突。
4、在初步设计方案确定后，应协助设计人员与行业内专家进行一次沟通，以优化设计方案。
医院中心实验室设计
医院中心实验室是集医疗、科研及教学于一体的综合性实验室，是开展科技攻关、学术交流和人才培养的重要基地，也是一个医院医疗水平高低的重要体现。
中心实验室一般设有：分子生物学平台、细胞生物学平台、免疫学与组织病理学平台、蛋白质组学平台、动物实验技术平台以及生物样本库等平台。
医院中心实验室的生物设计尤为重要，要注意：
①实验室（含缓冲间）围护绪构内表面必须光滑耐腐蚀、防水，以易于清洁。所有缝隙必须加以可靠密封。
②必须安装独立的通风空调系统以控制实验室气流方向和压强梯度；不得从实验室的其他部位或缝隙排向室外；同时确保实验室内的气流由“清洁”区域流向“污染”区域。
③缓冲间形成进入实验间的通道。必须设两道连锁门，当其中一道门打开时，另一道门自动处于关闭状态。如使用电动连锁装置，断电时两道门均必须处于可打开状态。在缓冲间可进行二次更衣。
④必须在实验室入口处的显著位置设置压力显示报警装置，显示实验间和缓冲间的负压状况，当负压指示偏离预设区间必须能通过声、光等手段向实验室内外的人员发出警报。可在该装置上增加送、排风过滤器气流阻力的显示。
医院检验科、病理科设计
检验科一般设有临床检验区、生化免疫区、微生物实、基因扩增区、HIV初筛区、辅助设施区。
病理科一般设有标本处理区、脱水区、包埋区、染色区、病理玻片区、快速切片区、特殊染色区、免疫组化区、辅助设施区等。
1、标本前处理区的设计：
①标本前处理室不得影响工作质量、质量控制程序、人员。
②应包括切片区和脱蜡区，其中脱蜡、水化及染色须在通风设施中进行。
③标本前处理室设备：应包括切片机、裱片机、切片刀及防样本交叉污染的用具、紫外灯、电热恒温箱、脱蜡缸、水化缸及HE染色缸。
2、分子病理实验室设计：
①原则上，临床基因扩增实验室（标本前处理区、试剂储存和准备区、标本制备区、扩增区、扩增产物分析区）并有独立的通风系统、缓冲间。
②根据使用仪器的功能，区域可适当合并，例如使用实时荧光PCR仪，扩增区、扩增产物分析区可合并；采用样本处理、核酸提取及扩增检测为一体的自动化分析仪，则标本制备区、扩增区、扩增产物分析区可合并。
3、原位杂交实验室设计：
实验区：用于标本预处理、消化、变性杂交、洗涤和封片等。使用荧光标记探针的检测应保证可以避光操作；
4、免疫组织化学实验室设计：
用于标本预处理、抗原修复、滴加一抗及二抗、DAB显色、苏木素对比染色、洗涤、脱水和封片等；